Occurrence of New Pathogenic Species of Streptomyces Causing Common Scab Disease on Potato Tubers in Egypt

Document Type : Original Article

Authors

1 Department of Plant Pathology, Faculty of Agriculture, Assiut University, Assiut, Egypt.

2 Department of Genetics, Faculty of Agriculture, Assiut University, Assiut, Egypt.

Abstract

This study was aimed to identify major species of Streptomyces that are able to cause potato common scab in Egypt. Potato tubers showing typical symptoms of common scab disease were collected from three different regions of Upper Egypt. The causal pathogens were isolated, and morphological, biochemical and pathogenicity tests were conducted in vitro to preliminary identify the isolated Streptomyces isolates. Moreover, the partial 16S rDNA gene sequencing was used to genetically identification of the isolates. Four new pathogenic species that have not previously been reported in Egypt were identified. Four species of Streptomyces rochei, S. rutgersensis, S. lateritius, and S. bottropensis were identified.  Isolates S1, S10, S14, S17, S18, S20, and S21 were identified as Streptomyces rochei, isolates S11 was identified as S. rutgersensis, isolates S13 identified as S. lateritius and isolates S15 was identified as S. bottropensis. To the obtained data, this is the first report that S. rochei, S. rutgersensis, S. lateritius, and S. bottropensis cause of potato common scab disease in Egypt. The different of obtained 16S rDNA sequences were deposited at NCBI GenBank with the following accession numbers: (S1) MZ267260, (S10) MZ267264, (S14) MZ267268, (S17) MZ267271, (S18) MZ267272, (S20) MZ267274, (S21) MZ267275, (S11) MZ267265, (S13) MZ267267, and (S15) MZ267269. The four newly identified isolates showed different pathogenicity, morphological and biochemical characteristics.

Keywords

Main Subjects

Article Title [العربیة]

ظهور أنواع جديدة ممرضة من الجنس البكتيري Streptomyces التي تسبب مرض الجرب العادي على درنات البطاطس في مصر

Authors [العربیة]

  • محمد عطا الله السيد حسن 1
  • عبد العال حمام شحاته 1
  • أمير عفت الفراش 2
  • هديل مجدي خليل 1
1 قسم أمراض النبات، كليه الزراعة، جامعه اسيوط، أسيوط، مصر.
2 قسم الوراثة، كليه الزراعة، جامعه اسيوط، أسيوط، مصر.
Abstract [العربیة]

تهدف هذه الدراسة إلى تحديد الأنواع الرئيسية من الجنس البكتيري  Streptomyces القادرة على إصابة نباتات البطاطس بمرض الجرب العادي في مصر. تم جمع درنات البطاطس التي تظهر عليها الأعراض النموذجية لمرض الجرب العادي من ثلاث مناطق مختلفة من صعيد مصر. تم عزل البكتيريا المسببة للمرض، وأجريت الاختبارات المورفولوجية والكيميائية والقدرة المرضية في المعمل لتعريف العزلات مبدئيا. علاوة على ذلك تم استخدام تسلسل جينات 16S RDNA الجزئي لتعريف العزلات وراثيا. تم تعريف أربعة أنواع جديده ممرضه لجنس Streptomyces لم يتم تسجيلها في مصر قبل ذلك. كانت الأنواع الأربعة هي Streptomyces rochei و S. rutgersensis و S. lateritius و S. bottropensis. تعريف العزلات S1 وS10 وS14 وS17 وS18 وS20 وS21 على أنها Streptomyces rochei، وتم تعريف العزلات S11 على أنها S. rutgersensis، وتم تعريف العزلات S13 على أنها S. Lateritius والعزلات S15 تم تعريفها على أنها S. bottropensis. وفقًا للبيانات التي تم الحصول عليها، هذا هو التقرير الأول الذي يشير إلى أن الانواع التالية لجنس Streptomyces :

S. rutgersensis، Lateritius ، S. bottropensis ، S. rochei يسببون مرض جرب البطاطس العادي في مصر. تم إيداع مختلف تسلسلات rDNA 16S التي تم الحصول عليها في NCBI GenBank بأرقام الانضمام التالية:     MZ267260(S1) ، (S10) MZ267264 ،(S14) MZ267268 ، (S17) MZ267271 ، (S18)  MZ267272، (S20) MZ267274، (S21) MZ267275، (S11) MZ267265، (S13) MZ267267 ، MZ267269 (5S1). أظهرت العزلات الأربع التي تم تشخيصها و تعريفها حديثا اختلافاً في الخصائص المرضية والمورفولوجية والكيميائية الحيوية.



Keywords [العربیة]

  • Potato (Solanum tubersum)
  • common scab
  • 16S rDNA gene sequencing
Assiut Journal of Agricultural Sciences

Articles in Press, Accepted Manuscript
Available Online from 17 May 2024

Files

Share

How to cite

Statistics