GENETIC VARIATION BETWEEN MALES AND FEMALES IN NILE PERCH (Lates niloticus) AS REVEALED BY RANDOM AMPLIFIED POLYMORPHIC DNA ASSAY

Document Type : Original Article

Authors

Department of Genetics, Faculty of Agricultural, Assiut University Assiut-Egypt

Abstract

Nile perch (Lates niloticus) is one of the most important aquacultural species in Egypt. The goal of this work is to search for sex-specific DNA sequences in the male and female genomes of Nile perch by comparative random amplified polymorphic DNA (RAPD) assays performed on pooled DNA samples. Fifteen 10-mer arbitrary primers were used in RAPD-PCR analysis in this investigation. All the primers were amplified successfully on the genomic DNA from samples of males and females and yielded distinct RAPD pattern. The numbers of fragments amplified per primer varied between 3 (OPO-17) and 13 (OPO-16) and had a size ranged from 215 to 2060 bp. A total of 104 bands were amplified, and out of them, 7 bands (6.73%) were polymorphic while another 97 bands (93.27 %) were monomorphic. Primers OPA-11 and OPO-17 generated female specific bands, while primers OPO-2 and OPO-14 generated male specific bands. The primer OPE-1 generated two specific bands: the first is specific for males and the second is specific for females. The other primers failed to generate any sex- specific bands. 
According to our knowledge these are the first sex-specific DNA markers isolated from a Nile perch fish species.

Keywords

Main Subjects

Article Title [العربیة]

الاختلافات الوراثية بين ذكور و اناث اسماك قشر البياض من خلال تحليل الدنا المتعاظم عشوائيا

Authors [العربیة]

  • مرفت محمد حشاد
  • نصر الدين ثابت حمدون
  • السيد عبد المنصف محمد
قسم الوراثة- كلية الزراعة- جامعة اسيوط-أسيوط-مصر
Abstract [العربیة]

تعد اسماك قشر البياض واحدة من اهم الانواع السمكية الموجودة في مصر وقد استهدفت هذه الدراسة البحث عن تتابعات الـDNA  الخاصة بجنس معين في جينوم الذكور او الاناث من خلال مقارنة طرز الدنا المتعاظم عشوائيا المشتقة من عينات الـDNA  المجمعة من كل من الذكور و الاناث حيث يعتمد هذا التكنيك علي تفاعل البلمرة المتسلسل الذي يستخدم بادئات تقوم بتكبير او تعظيم مناطق محددة من الجينوم.
تم الحصول علي طرز حزمية مميزة لكل بادئ مع كل من الذكور والإناث، وقد إختلف عدد الشظايا الناتجة لكل بادئ من  3-13 بمتوسط 6.94 حزمة لكل بادئ وتراوحت أحجام شظايا الدنا المتعدد المظاهر المتعاظم عشوائيا بين 215-2060 زوج من القواعد. وقد أظهرت 7 حزم (بنسبة 6.73%) من 104حزمة تعددا مظهريا ووجدت 97 حزمة مشتركة بين الذكور و الاناث في العينات المدروسة. وقد أظهر البادئ OPO-16  أكبر عدد من حزم الدنا (13 حزمة) في الوقت الذي أظهر فيه البادئ OPO-17  أقل عدد من هذه الحزم (3 حزمة). وقد أعطي البادئOPA-11  حزمة واحدة مميزة للاناث بينما أعطي البادئ OPO-17  حزمتين مميزتين للإناث. و اعطي كل من البادئان OPO-2  و OPO-14 حزمة واحدة مميزة للذكور. وقد أعطي البادئ  OPE-1 حزمة واحدة مميزة للذكور و أخري مميزة للإناث. بينما لم تظهر باقي البادئات اي حزم مميزة للذكور عن الاناث.

Files

Share

How to cite

Statistics