Assessment of genetic diversity using SCoT markers and some morphological traits in ten lines of barley (Hordeum vulgare L.)

Document Type : Original Article

Authors

1 Department of Genetics, Faculty of Agriculture, Mansoura University, Egypt.

2 Benghazi Univ., Faculty of Agriculture, Horticulture Department

3 Department of Agronomy, Faculty of Agriculture, Mansoura Univ

Abstract

To assessment molecular and phenotypic diversity for ten barley lines belong to Hordeum vulgare L., ten SCoT primers were used and 12 morphological traits were estimated in two seasons (2018/2019 and 2019/2020). The SCoT primers succeeded in generating reproducible and reliable amplicons. SCoT technique showed that 66.67 % to 100% of polymorphism. The resolving power (Rp) value varied from 4 to 11.40. In addition, the 10 lines were characterized by 41 unique markers (22 positive and 19 negative). B6 had the highest numbers of positive markers (six). According to phenotypic evaluation, the mean squares for genotypes were highly significant for all studied traits from combined data over two seasons. The heritability values in broad sense (h2b %) ranged from 40.63 (100-grain weight) to 99.22 (Days to heading). The P7 gave desired value in four traits (NT/P, NS/P, NG/S and GY/P g) and the other lines showed desired value in one or two trait, thus all traits which detected in the ten lines might be associated with all unique markers distinguished in this study. The inbred line P6 showed the highest number of unique markers (6 positive), one or some of which may be linked with grain filling period (GFP day) trait that showed in line desirable value. Consequently, these markers may be used as selectable markers for genetic improvement of these traits in barley.

Keywords

Main Subjects


Article Title [العربیة]

تقدير التنوع الوراثى باستخدام واسمات SCOT وبعض الصفات المورفولوجية فى عشرة سلالات من الشعير

Authors [العربیة]

  • رحاب محمد حبيبه 1
  • جميلة عبد الحفيظ بشاشة 2
  • سعاد حسن حافظ 3
  • أحمد عبد الرحيم عبد الرحيم ليلة 3
1 قسم الوراثة- کلية الزراعة - جامعة المنصورة - مصر
2 جامعة بنغازي ، کلية الزراعة ، قسم البساتين
3 قسم المحاصيل – کلية الزراعة – جامعة المنصورة
Abstract [العربیة]

لتقدير التنوع الجزيئى والمظهرى لعشرة سلالات من الشعير Hordeum vulgare L.)) , تم استخدام عشرة بادئات من SCOT بالاضافة لتقدير 12 صفة مورفولوجية فى موسمين (2018/2019 و 2019/2020). هذه البادئات نجحت فى انتاج العديد من تتابعات DNA المتباينة. أظهر تکنيک SCoT تنوع جزيئى يتراوح من 66.67 الى 100% , وکانت قيمة متوسط قوة التحليل Rp تتراوح من 4 الى 11.40. بالاضافة الى ان السلالات العشر اظهرت 41 واسمة جزيئية متنوعة ومنفردة (22 موجبة و 19 سالبة), اعطت السلالة B6 اعلى عدد من الواسمات الجزيئية الموجبة.
تبعا للتقييم المظهرى, کان التباين الراجع للتراکيب الوراثية عالى المعنوية لکل الصفات المدروسة وکانت قيمة معامل التوريث فى المدى الواسع تتراوح من 40.63 الى 99.22 %. أعطت السلالة B7 قيما مرغوبة ومختلفة عن باقى السلالات فى أربع صفات NT/P, NS/P, NG/S and GY/P g)), بينما اعطت کل سلالة من السلالات الأخرى قيم مرغوبة فى صفة او صفتين فقط , ولهذا فان هذه الصفات التى تميزت بها العشر سلالات من الشعير ربما يمکن ربطها مع الواسمات الجزيئية المنفردة التى تم الحصول عليها. السلالة B6 أظهرت اعلى عدد من الواسمات الجزيئية الموجبة والمتفردة (سته واسمات ايجابية) فإن واحدة او اکثر من هذه الواسمات قد تکون مرتبطة مع الصفة التى أعطت فيها هذه السلالة قيم مرغوبة (GFP day) عن باقى السلالات . وهذا يدل على أن هذه الواسمات الجزيئية المنفردة ربما يمکن استخدامها کعلامات انتخابية فى برامج التربية للتحسين الوراثى لهذه الصفات فى الشعير.

Keywords [العربیة]

  • الشعير
  • التنوع
  • الوراثى