A comprehensive RRM domains sequence analysis from nucleolin proteins in plants

Abou-Ellail, M.

doi:10.21608/ajas.2021.89875.1037

A comprehensive RRM domains sequence analysis from nucleolin proteins in plants

Document Type : Original Article

Author

M. Abou-Ellail

Department of Genetics, Faculty of Agriculture and Natural Resources, Aswan University, Aswan 81528, Egypt

10.21608/ajas.2021.89875.1037

Abstract

In contrast to yeast and animal cells, plants contain two genes which is encoding to nucleolin proteins. A comprehensive protein sequence analysis revealed that the two RNA recognition motifs (RRM) domains are highly conserved and suggesting that the mechanisms and functions related to RNA contained RRMs are highly conserved in both plant nucleolin proteins sequences. Whereas Ribonucleoprotein 1 (RNP1) and Ribonucleoprotein 2 (RNP2) that are highly conserved sequences in RRMs from yeast and animal nucleolin, also my study confirmed that RNP1 and RNP2 sequences are conserved in plants. Nucleolin could use the same manner in the different species of plants and animals to achieve its function. Study of evolutionary relationships among nine different plant species revealed that monocots and dicots form two separated monophyletic group meaning that they composed of a collection of organisms, share a common evolutionary history and including the most recent common ancestor of all those organisms.

Keywords

Main Subjects

Genetics

Article Title [العربیة]

تحليل شامل لتتابعات منطقة ال RRM في بروتينات النيوکليولين في النباتات

Author [العربیة]

محمد احمد ابو الليل

قسم الوراثة- کلية الزراعة والموارد الطبيعية-جامعة اسوان-اسوان

Abstract [العربیة]

تحتوي النباتات ، على عکس الخلايا الحيوانية والخميرة ، على إثنين من الجينات التي تشفر للبروتينات النيوکليولين. وأوضح التحليلات الشاملة لتتابعات البروتين أن منطقة الـ RRM محافظة بشکل کبير جداً ، مما يشير إلى أن الآليات والوظائف المتعلقة بـالـ RNA المحتوي عليها أيضا محافظة في کلاً من تتابعات البروتينات بالنوکليولين في النبات. أيضا أوضحت تلک الدراسة أن تتابعات الـ RNP1 و RNP2 تکون متواجدة بصورة محافظة جدا في جميع الـ RRMs في بروتينات النيوکليولين المتواجدة في الخميرة والحيوان ، أيضا أظهرت النتائج أن تتابعات الـ RNP1 و RNP2 محافظة جدا في جميع النباتات تحت الدراسة. ومن الواضح ان بروتينات النيوکليولين في الأنواع النباتية المختلفة يمکن أن تستخدم نفس الوسيلة کما في الحيوان للقيام بوظائفها. وکشفت دراسة العلاقات التطورية بين تسعة أنواع نباتية مختلفة باستخدام تتابعات الـ RRMs أن نباتات أحادية الفلقة ونباتات ثنائية الفلقة تُشکل مجموعتين منفصلتين، مما يعني أنها تتکون من مجموعة من الکائنات الحية التي لها تاريخ تطوري مشترک وتشمل أحدث سلف مشترک لجميع هذه الکائنات الحية.

Keywords [العربیة]