Mohamed, G., Youssef, M., Mohamed, E., Mahgoub, A. (2021). Identification of Sex-specific Molecular Markers in Barbel and Nile Carp using SCoT and ISSR Markers. Assiut Journal of Agricultural Sciences, 52(1), 60-73. doi: 10.21608/ajas.2021.171568
G. I.A. Mohamed; Muhammad Youssef; E. A. Mohamed; Aya A. Mahgoub. "Identification of Sex-specific Molecular Markers in Barbel and Nile Carp using SCoT and ISSR Markers". Assiut Journal of Agricultural Sciences, 52, 1, 2021, 60-73. doi: 10.21608/ajas.2021.171568
Mohamed, G., Youssef, M., Mohamed, E., Mahgoub, A. (2021). 'Identification of Sex-specific Molecular Markers in Barbel and Nile Carp using SCoT and ISSR Markers', Assiut Journal of Agricultural Sciences, 52(1), pp. 60-73. doi: 10.21608/ajas.2021.171568
Mohamed, G., Youssef, M., Mohamed, E., Mahgoub, A. Identification of Sex-specific Molecular Markers in Barbel and Nile Carp using SCoT and ISSR Markers. Assiut Journal of Agricultural Sciences, 2021; 52(1): 60-73. doi: 10.21608/ajas.2021.171568
Identification of Sex-specific Molecular Markers in Barbel and Nile Carp using SCoT and ISSR Markers
1Genetics Department, Faculty of Agriculture, Assiut University
2Department of Genetics, Faculty of Agriculture, Assiut University, Assiut, Egypt
Abstract
The present study aimed to investigate molecular sex differences between males and females of two members of family Cyprinidae in Egypt namely Benni and Lebeis using two different molecular markers i.e., start codon targeted polymorphism (SCoT) and inter simple sequence repeats (ISSR). The bulked DNA sample for each gender of the tested species was screened with eight primers from each marker. However, SCoT marker was more efficient than ISSR marker by showing higher number of possible sex-specific bands in the two tested species. SCoT primers were able to generate 7 and 4 male-specific bands, along with two and 5 female-specific bands for B. bynni and L. niloticus, respectively. Whereas, ISSR primers generated 4 and two male-specific bands, vis-à-vis two and three female-specific bands for B. bynni and L. niloticus, respectively. Interestingly, SCoT-01 primer generated unique common female specific band (690bp) which appeared only in the females of Benni and Lebeis. This band is more possible to be female sex-specific. The results obtained in this study could serve as a keystone for molecular sex differentiation studies in the two tested species and other fish species. However, increasing the number of analyzed individuals is highly recommended.
تحديد الواسمات الجزيئية الخاصة بالجنس في أسماک الليبس النيلي والبني الأصيل باستخدام واسمات SCoT و ISSR
Authors [العربیة]
جمال إبراهيم أحمد محمد1; محمد احمد الملقب بالخرشی محمد یوسف2; السيد عبد المنصف محمد1; آية أحمد محجوب1
1قسم الوراثة – کلية الزراعة – جامعة أسيوط
2قسم الوراثة- کلیة الزراعة – جامعة اسیوط
Abstract [العربیة]
کان الهدف من الدراسة الحالية دراسة الفروق الجنسية بين الذکور والإناث في نوعين من الأسماک التابعين للعائلة Cyprinidae في مصر المعروفين باسم البني والليبس، وذلک باستخدام نوعين من الواسمات الجزيئية الـ SCoT والـ ISSR. تم تحليل المادة الوراثية المجمعة من عدة أفراد لکل جنس من کلا النوعين بواسطة ثماني بادئات من کل واسم جزيئي. إتضح أن، الواسم SCoT کان أکثر فعالية من الواسم ISSR من خلال إظهار عدد أکبر من الحزم المحتمل أنها خاصة بالجنس في کلا النوعين تحت الدراسة. حيث أنتجت البادئات الخاصة بالـ SCoT عدد سبعة حزم وأربعة حزم خاصة بالذکور وأيضاً عدد حزمتين وخمسة حزم خاصة بالإناث في السمک البني والليبس على الترتيب. بينما أظهر الواسم ISSR عدد أربعة حزم وحزمتين خاصة بالذکور بالإضافة إلى عدد حزمتين وثلاث حزم خاصة بالإناث في نوعي البني والليبس على الترتيب. وجدير بالذکر تمکن البادئ (SCoT-01) من إنتاج حزمة فريدة خاصة فقط بالإناث من کلا النوعين (بحجم 690 زوج قاعدة نيتروجينية). ومن المرجح أن تکون هذه الحزمة متخصصة بجنس الإناث وبالتالي فيجب عزلها وتحديد التتابع الخاص بها. تعتبر النتائج المتحصل عليها في هذه الدراسة بغاية من الأهمية، حيث يمکن اعتبارها حجر أساس لدراسات تمييز الجنس في نوعي السمک محل الدراسة والأنواع السمکية الأخرى. ولکن، من الموصي به زيادة عدد الأفراد الواجب تحليلهم في الدراسات المقبلة.
Top