استخدام تقنية RAPD-PCR وفصل البروتينات الذائبة بطريقة (SDS-PAGE) analysis للتفرقة بين عزلات البكتيرة ايروينيا كاروتوفورا كاروتوفورا وعلاقتها بالقدرة الامراضية

تم عزل ثماني عشرة عزلة من البكتيرة ايروينيا كاروتوفورا كاروتوفورا من مناطق مختلفة، تم اختيار ثلاث عزلات منها تختلف فى قدرتها الامراضية على درنات اصناف مختلفة من البطاطس وهى نيقولا، سبونتا، دراجا، فالور، انابل، دايمونت، هيرمس، ليدى روزيتا، كوراج وذلك لدراسة إمكانية التفرقة بين عزلات البكتيرة ايروينيا كاروتوفورا عن طريق فصل البروتينات الذائبة باستخدام طريقة analysis  (SDS-PAGE) وكذلك تقنية RAPD-PCR  وعلاقة ذلك بالقدرة الامراضية للعزلات البكتيرية. واوضحت النتائج ان الثلاث عزلات تختلف فى هذا الصدد حيث ان العزلة A هى اقوى العزلات يليها العزلة B ثم العزلة C وان اصناف دايمونت، نيقولا، انابل، ليدى روزيتا كانت اقل قابلية للاصابة على التوالي وان اصناف سبونتا، دراجا، هرمس هى الاكثر قابلية للاصابة على التوالى بينما كانت الاصناف كوراج، فالور متوسطة القابلية للاصابة .
وقد اثبتت النتائج المتحصل عليها وجود فروق بين العزلات الثلاث فى عدد الاشرطة البروتينية ( الحزم البروتينية ) ووزنها الجزيئى حيث وجد 10 حزم بروتينية polymorphic  ذات اوزان جزيئية 120، 100، 70، 60، 50، 45، 40، 24، 20، 19 KDa  بينما وجدت اربع اشرطة بروتينية monomorphic متماثلة فى العزلات الثلاث ذات اوزان جزيئية 10 ، 15 ، 17 ، 25 KDa . كما اظهرت الدراسة وجود اختلافات فى عدد الاشرطة البروتينية الناتجة وكذا اوزانها الجزيئية بين الثلاث عزلات عند استخدام تقنية RAPD-PCR حيث وجد ثلاث عشرة حزمة بروتينية مميزة بين الثلاث عزلات. كما انه بدراسة شجرة النسب الوراثية للثلاث عزلات وجد ان درجة التماثل بين العزلتينA   ,  B كانت 71% بينما العزلة C  كانت درجة التماثل بينها وبين كل من العزلتين A  ، B 43% , 36% على التوالي . كما ان دراسة شجرة النسب الوراثية وضعت الثلاث عزلات فى عنقودين اساسيين هماA  ،  B فى عنقود والعزلةC  فى عنقود آخر مما يشير الى وجود قرابة وتشابة بين العزلتينA   ،  Bعلى مستوى الـ DNA ويشير الى علاقة ذلك بالقدرة الامراضية.